由於1月11日花蓮地區深夜的地震與大雨雙重因素影響，導致蘇花公路台9線159K+300處的大清水隧道與錦文隧道之間的明隧道，有著長達25公尺的嚴重坍方意外，為了能趕在1月15日17時搶修通車，公路總局目前針對台9線158K至167K處實施交通管制，還有要通行蘇花路廊的民眾可得要多注意。為了解決蘇花路廊雙向中斷的運輸問題，交通部也釋出了鐵路、公路的替代道路方案，其中最短的花蓮宜蘭往來替代方案就至少耗時6小時，海運的台北快輪／合富輪已經確定會在今日下午與明日（1月12日）陸續投入輸運，空運的立榮航空目前還在協調中。
在鐵路運輸的部分，交通部表示台鐵將加開每日12班宜花區間車，及啓動貨物列車蔬果北運機制；從今日（1月11日）下午起啓動加開宜蘭至花蓮區間快車來回共6班次，而1月13日起至15日止，每日加開宜蘭至花蓮區間快車12班次。台鐵預計共加開42列區間快車，沿途均停靠宜蘭、羅東、蘇澳新、南澳、和平、新城、花蓮等站，原本周末時段開行之28列次加班車均正常開行，並會視旅客搭乘情況，來適度開放立位或增停車站來疏運。
至於公路方面，如果是自小客車或是機車的話，宜蘭花蓮往返就只能利用中橫公路台八線轉接台七甲線來通行，路程粗估至少要六小時，比起原本台9線蘇花公路的1個半小時路程很可能要多五個小時的時間；不過公路總局表示，中橫目前仍是災害路段無法讓大車行駛，所以從花蓮出發的各類貨車如果要運送至台北，就得西往南至台東，再從南迴接到西部地區，再來利用高速公路抵達台北，路程很可能是八個小時起跳。
對於蔬果運送的困難，除了有交通部啟動貨物列車蔬果北運機制之外，花蓮縣政府也啟動了蘇花公路中斷農產品轉運補助措施，補貼農民在道路中斷期間新增的運輸成本。短期內公路總局的規劃是希望在1月15日搶通坍方路段，長期目標則是加快該路段9.5公里的長隧道開發，環評應會在今年就送件至環保署。
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